هدف:باکتری ها کارخانه های بی همتای بیولوژیک در تولید محصولات زیست فناوری هستند. برخی ویژگی ها نظیر تحمل شرایط خاص رشد و تولید آنزیم های مختلف، باکتریها را جهت تولید و بهره برداری مورد توجه قرار داده است. عده ای از باکتری ها واجد عوامل ژنتیکی با قابلیت جابه جایی هستند. از این عوامل می توان به اینترون های گروه II اشاره کرد که نه تنها به کمک آنزیم هایی که کد می کنند، قادر به برش خود هستند، بلکه قادرند در محل دیگری از ژنوم باکتری جایگزین شوند. اساس این جایگزینی، برقراری پیوند هیدروژنی بین بخش کوچکی از اینترون و توالی مکمل آن در جایگاه هدف است. این جابه جایی با مهندسی ژنتیک قابل هدایت می باشد و از آنجا که قرار دادن توالی خارجی درون اینترون در جابه جایی آن اختلال ایجاد نمی-کند، افق روشنی برای ژن درمانی پدیدار می شود. از سوی دیگر سه آنزیم با ارزش وارونوشتاز ,(reverse transcriptase) آندونوکلئاز ,(endonuclease) مچوراز (maturase) توسط این اینترون ها کد می شود. وجود اینترون های مزبور در باکتری های ترموفیل، زمینه های بهره برداری قابل توجهی را فراهم می آورد. هدف از این پژوهش شناسایی باکتری های ترموفیل بومی ایران که دارای اینترون گروه II هستند می باشد.مواد و روش ها: به منظور شناسایی اینترون گروه II، بخش حفاظت شده آن در باکتری ها با استفاده از نرم افزار های بیوانفورماتیک شناسایی و با استفاده از نرم افزار Gene runner پرایمر اختصاصی طراحی شد.DNA ژنومی از باکتری بومی استخراج و PCR در شرایط بهینه انجام گرفت. باکتری های دارنده اینترون به منظور شناسایی ژن آنزیم ترانسکریپتاز معکوس، با روش PCR مورد بررسی بیشتر قرار گرفتند.نتیجه: دو باکتری ترموفیل بومی جدا شده از چشمه های آب گرم ایران در بررسی اولیه توسط تکنیک PCR واجد اینترون گروه II بودند. در بررسی بعدی وجود ژن trt که رمز کننده آنزیم ترانس کریپتاز معکوس می باشد، در این باکتری ها به اثبات رسید.بحث: باکتری های بومی مورد بررسی می توانند جهت همسانه سازی (cloning) ژن trt و تولید آنزیم گرما دوست مورد استفاده قرار گیرد.